El programa de Magíster en Educación fue diseñado para profesionales que desean desarrollar y expandir sus habilidades y conocimientos para tomar una posición de liderazgo ya sea en su enseñanza y el desarrollo del currículo, la gestión o la orientación educativa. Busca formar especialistas que sean capaces de analizar las tendencias y problemáticas educativas, diseñar soluciones y dar respuesta a los requerimientos actuales y futuros del sistema educativo nacional. El programa busca aportar al desarrollo educativo nacional e internacional, recogiendo la experiencia de sus docentes y presentando una visión de la educación bajo un paradigma cristiano. 

El Magíster en Salud Púbica está dirigido a profesionales de salud y disciplinas afines que deseen ser líderes de cambio en el campo de la Salud Pública e interesados en adquirir competencias para contribuir a mejorar la salud a nivel poblacional, gestionando los procesos necesarios para lograrlo y utilizando herramientas de análisis crítico para la toma de decisiones, considerando a los  determinantes sociales de la salud como pilares y a la equidad como prioridad, con la finalidad de aportar  al desarrollo de la salud pública a nivel  nacional e internacional, fundamentada en una cosmovisión bíblica cristiana.

El Magister en Misión con mención en Teología y Salud es un programa dictado por la Facultad de Teología en conjunto con la Dirección de Posgrado de la Universidad Adventista de Chile, y en colaboración con Los Ministerios de Salud de la Asociación General de la Iglesia Adventista del Séptimo Día. Este programa es único en el mundo en su propósito y estructura porque esta designado para capacitar a profesionales adventistas, especialmente en teología y salud, a desempeñarse como líderes de proyectos misionales eclesiásticos y comunitarios orientados a la salud.

El programa de Magíster en Ciencias de la Motricidad Humana (CMH) está diseñado y dirigido a profesionales involucrados en el área de la Actividad Física, Educación y Salud, a saber, Profesores de Educación Física, Licenciados en Educación, Licenciados en Ciencias de la Actividad Física y el Deporte, Educadoras de Párvulos, Kinesiólogos, Fisiólogos, Fisioterapeutas, entre otros que cuenten con los requisitos de admisión declarados en el reglamento de posgrado. Siendo un programa de carácter profesionalizante, tiene como propósito preparar especialistas en el área de la Ciencias de la Motricidad Humana con capacidad para resolver situaciones y/o problemáticas de carácter disciplinar y profesional, con pensamiento crítico, analítico y reflexivo y con capacidades para innovar y liderar intervenciones afines en cualquier nivel del plano disciplinar, posicionándoles desde una cosmovisión bíblico-cristiana en la comprensión de este paradigma, al tiempo que se identifica cómo otras ciencias (de la Salud, del Deporte) pueden contribuir en el estudio de la Motricidad Humana.

El magister es semi-presencial de carácter profesional orientado al desarrollo de competencias para la profundización, especialización y aplicación del conocimiento en su quehacer disciplinar, por lo tanto, los estudiantes podrán desarrollar proyectos de intervención o tesina que aporte al campo profesional, en las principales necesidades de los contextos educativos, como los procesos de enseñanza-aprendizaje, inclusión escolar, intervención en las necesidades educativas especiales NEE y convivencia escolar.